1、性质不同：玉米自交系是玉米育种家将自然选择或人工创新的玉米材料连续自交、选择后，获得的遗传稳定、生长整齐一致的玉米品种。玉米杂交种是两个或两个以上的自交系或品种杂交后所获得的种子。单杂交种是两个品种或两个自交系杂交所产生的杂种。
2、特点不同：单交种性状一般比较整齐，常表现出强大的生活力和杂种优势。杂交是通过不同稻种相互杂交产生的，而水稻是自花授粉作物。生产上应用的品种几乎都是两个自交系杂交后的单交种。
3、原理不同：双交种制种较复杂，但制种产量高，种子成本低。 单交种可在生产上连续应用多年，不必年年制种，但要注意每年选优留种。
扩展资料：
注意事项：
1、选择在当地至少进行了3年以上试验示范的品种：选择多年多点表现较好的品种，生产上出现各种灾难性损失的可能性就较小。
2、选择生产潜力大、适应性广的品种：品种的生产潜力体现在产量水平上，要根据评比试验的产量结果，而不要仅仅因为穗子的大小、双穗率等性状选择品种。由于气候的不可预测性和多变性，要选择在多点、多地区、多环境下都具有较高产量水平的品种。
3、选择高抗倒伏的品种：选择抗倒伏的品种非常重要，尤其是多风地区。
