采样员主要的工作职责：1、做好采样器材准备，确保数量充足、质量合格；2、做好采样过程应严格按标准规程操作，并做好个人防护；3、按照相关技术要求选择正确、有效的采样方法，科学布点；4、熟练仪器性能及操作规程，熟练掌握各种快速检测及应急检测方法，掌握国内外采样的新技术、新方法。
除了上述职责之外，还有做好标本的登记、编号标识，认真填写送检单，保证相关信息完整，保证样品流转无差错，样品质量不改变；采样严格按照生物安全相关规定进行，做好生物安全防护；样本的包装和运输严格按照相关生物安全规定进行；做好采样后的现场清理工作，对废弃的采样器材、防护器材进行消毒处理；按正确的运输保藏条件将样品及时送交相关实验室；遵守保密制度， 不违规泄露相关检测信息。
